中心設中心主任一名，並設置諮詢委員數名，針對發展方向、資訊技術與資源共享技術進行諮詢與協助。中心主任下設置資訊安全組、資源管理組、資料科學組、系統測試組、系統發展組、行政服務組、企劃推廣組及人工智慧組，各組設置組長1人，組長由中心主任遴聘兼任之，襄助中心主任推動產學合作與技術研發等業務。各組之下分別聘任若干名技術人員及行政專員，執行中心相關計畫與行政業務，並積極推動各項技術合作與開發事宜。